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本发明提供了一种新的脑功能磁共振成像方法和系统,其方法包括:获取基于多通道并行且稀疏采样获得的每一个相控阵线圈对应的动态数据图像和第一参考图像;根据所述第一参考图像,获得每个相控阵线圈在每个动态数据图像获取时刻处的基准图像;根据所述基准图像,获得高阶广义级模型的基函数;利用L2范数对高阶广义级模型的级系数进行约束,基于所述动态数据图像和所述基函数估计获得所述级系数;根据所述级系数的估计值和所述基准图像,基于高阶广义级模型重建出每个通道各个时间点对应的中间图像;基于相控阵线圈的敏感度矩阵,对所述中间图像进行并行重建,获得重建后的动态脑功能磁共振图像。其解决了现有技术成像技术中存在图像几何畸变以及奈奎斯采样伪影问题。