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本发明公开了一种农产品检测系统及其检测方法,包括水蒸气发生装置、水蒸气液化收集装置、农产品搅拌取样装置、待测液暂存滴液装置和蒸馏水暂存滴液装置;所述水蒸气发生装置通过水蒸气引导管与水蒸气液化收集装置连接;所述水蒸气液化收集装置的蒸馏水排出口连接有双通管,所述双通管的其中一个排出管口通过蒸馏水排出管与蒸馏水暂存滴液装置连接,所述双通管的另外一个排出管口位于农产品搅拌取样装置正上方,且农产品搅拌取样装置通过待测液排出管与待测液暂存滴液装置连接。本发明提供的一种农产品检测系统及其检测方法,能够快速检测出农产品表面农药残留的高低,检测准确性较高,便于推广。