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本发明涉及一种利用模拟移动床从银杏叶提取物中分离黄酮类化合物的方法,包括如下步骤:(1)取适量银杏叶黄酮提取物将其配制成浓度为40 60g/L的甲醇溶液作为进料液;(2)将步骤(1)得到的进料液进入模拟移动床系统分离得式I结构的黄酮化合物;步骤(1)所述银杏叶黄酮提取物中式I、式II化合物的含量在25%以上,式I、式II结构如下:。