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本实用新型公开了一种基于生物工程的高效轴向高压制备色谱柱,其结构包括色谱柱、进水连接管、水冷散热器、出水连接管、固定支柱、压力传动装置、限位器、控制器、泄压阀杆、泄压阀座、高压制备色谱柱控制台、支撑底座、活动脚轮、储料柱筒、输料管,本实用新型通过设有水冷散热器,在进行使用时,由进水连接管将冷却液从进水口输送至水冷散热槽,水冷散热槽内部有多条水道,水冷散热槽通过与色谱柱接触并将吸收色谱柱的热量,使得色谱柱的温度能快速降低,减少在线色谱分析仪表的分析周期,从而实现了该高压制备色谱柱在使用时拥有可以有效的降低色谱柱的降温时间,提高设备的工作效率,实用性强。