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本发明属于农业饲料添加剂领域,公开了一种可替代抗生素的果壳提取物及其制备方法与应用。所述可替代抗生素的果壳提取物,由40~70wt%的核桃果外壳、20~50wt%的栗子果外壳及10~40wt%的茶果外壳混合提取后干燥制备而得。制备方法包括以下步骤:(1)将核桃果外壳、栗子果外壳及茶果外壳混合,加入水和酶的混合溶液进行第一次提取,过滤所得滤渣用乙醇水溶液进行第二次提取,过滤,合并得到果壳提取物滤液;(2)将果壳提取物滤液减压浓缩,干燥得到所述可替代抗生素的果壳提取物。所述果壳提取物可以替代抗生素添加在动物饲料或饮用水中,添加量为0.05~1%,用于提高畜禽的抗病能力和细菌感染性畜禽疾病的防治。