本发明提供了一种基于狭缝声子晶体的微粒操控系统及方法,该微粒操控系统包括:狭缝声子晶体结构、微流控器件封装结构、超声电子系统及光学观测系统,所述狭缝声子晶体结构封装于所述微流控器件封装结构内;所述狭缝声子晶体结构由两块刻有周期性结构的平板组成,并且两块平板间隔一设定距离平行设置;所述超声电子系统用于控制发射超声波,激励所述狭缝声子晶体结构内部产生局域场;所述光学观测系统用于观测所述狭缝声子晶体结构的狭缝内的微粒的运动状态。本发明利用狭缝声子晶体这种声人工结构,在尺寸远小于声源波长的狭缝内产生超强局域梯度声场,利用强局域梯度声场产生的声辐射力操控并捕获远小于波长的颗粒。